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國內流感及新冠疫情均處流行期，且流感疫情持續上升，單周類流感門急診就診人次，較前一週上升16.5%，且單周週(9/8-9/14)新增92例流感併發重症病例(79例H1N1、5例H3N2、8例A未分型)及21例死亡(18例H1N1、2例H3N2、1例A未分型)。至於新冠疫情，單周(9/8-9/14)新增53例本土重症病例及18例本土死亡病例。
疾管署指出，國內流感疫情第36週(9/6-9/12)類流感門急診就診，共計136,796人次，依實驗室監測資料顯示，目前社區中流行之流感病毒以A型為主，其中以A型H1N1占82.2%為高。本(114-115)流感季累計1,421例重症病例(800例H1N1、503例H3N2、28例A未分型、90例B型)及274例死亡(149例H1N1、104例H3N2、9例A未分型、12例B型)，其中重症病例以65歲以上長者(占65.0%)及具慢性病史者(占82.7%)為多，68.3%未接種本季流感疫苗。
至於新冠肺炎疫情，雖然轉趨下降，但仍處流行期， 第36週(9/6-9/12)新冠門急診就診計17,847人次，較前一週(8/30-9/5)下降13.3% ；上週(9/8-9/14)新增53例本土重症病例及18例本土死亡病例。去(2025)年10月起累計675例新冠併發重症本土病例，其中124例死亡，重症病例以65歲以上長者(占73.3%)及具慢性病史者(占82.8%)為多，83.6%未接種本季新冠疫苗；近4週本土病例變異株以NB.1.8.1 及PQ.16.1.1為主。
疾管署提醒，隨著入秋氣溫逐漸轉涼，請民眾注意自身狀況，尤其若是自身及親友為65歲以上長者、嬰幼兒、高風險慢性病人及孕婦等流感高危險群，應特別留意健康狀況，如有發燒、咳嗽等類流感症狀，應戴口罩及早就醫、生病在家休息等措施；如有危險徵兆(如呼吸急促、呼吸困難、發紺、血痰、胸痛、意識改變、低血壓等)應儘速就醫，並由醫師評估是否符合公費流感抗病毒藥劑用藥條件，以把握用藥時機，降低併發重症風險。
